La section Bongarsiana/Codices accueille la collection du diplomate et humaniste français Jacques Bongars (1554—1612). Cet ensemble d’envergure internationale comprend 650 manuscrits du Moyen Age et de l’époque moderne et environ 150 fragments, provenant en majorité de monastères orléanais et strasbourgeois. A cela s’ajoutent 3000 ouvrages imprimés, qui sont gérés par le Zentrum Historische Bestände (Centre des collections historiques) de la Bibliothèque universitaire de Berne. A la mort de Bongars, la collection revint par héritage à Jakob Graviseth, fils d’un banquier strasbourgeois, lequel épousa Salome von Erlach, fille d’un avoyer de Berne. C’est ainsi que la Bongarsiana passa d’abord de Strasbourg à Bâle, puis en 1632 à la Bibliothèque de Berne.
Au noyau primitif appartiennent 125 manuscrits provenant de couvents supprimés à la Réforme et de bibliothèques privées. Par des donations et des achats, la collection s’enrichit ensuite de manuscrits européens, en majorité de l’époque moderne (environ 200), orientaux (60), grecs (40) et hébreux (30). La section Bongarsiana/Codices comprend aujourd’hui plus de 1100 manuscrits. Pour consulter la collection, il est indispensable d’annoncer sa visite à l’avance. 118 manuscrits ont été numérisés et sont consultables sur le site e-codices.
