La Bibliothèque de la Bourgeoisie de Berne, en tant que responsable des archives administratives de la Commune bourgeoise, conserve les archives des institutions de la Bourgeoisie. Dans le cas du Casino culturel (Kultur-Casino), il s’agit surtout de plans et autres documents architecturaux. Les archives du Musée d’histoire naturelle contiennent les papiers personnels de certains savants, mais les archives scientifiques restent dans les locaux du Musée. Les documents de l’Hôpital des bourgeois couvrent une longue période et des sujets très variés, mais, tout comme ceux du Home des bourgeois, ne disent rien sur les anciens occupants. Les archives du Foyer bourgeoisial pour la jeunesse conservent des documents sur les diverses fonctions du nouvel orphelinat fondé en 1757.

Toutes les sous-sections sont l’objet d’une brève présentation dans le catalogue en ligne des archives. 

Casino
14.2 mètres linéaires de documents d’archives et plans, XIXe siècle—1997
A l’exception de quelques comptes annuels, pratiquement aucun document administratif ne se trouve dans ce fonds. Celui-ci contient essentiellement des dossiers relatifs aux travaux de construction et de nombreux plans; y sont en outre conservés des agendas et de la documentation concernant des évènements qui eurent lieu au Casino. La direction du Casino ayant relevé de différentes divisions au cours du temps, certains documents anciens ou récents concernant sa construction ne se trouvent pas dans ses archives, mais dans celles de la Commission des champs et forêts, de l’Administration des domaines et de la Chancellerie de la Bourgeoisie.

Foyer bourgeoisial pour la jeunesse (ancien orphelinat)
37.5 mètres linéaires de documents d’archives, XVIIe—XXIe siècles
Les archives du Foyer bourgeoisial pour la jeunesse documentent l’activité des autorités de l’orphelinat, nouvellement fondé en 1757: correspondance, procès-verbaux, comptes et dossiers concernant les bâtiments, le service et les occupants. Elles ne contiennent pas de documents concernant l’orphelinat et la maison de correction du XVIIe siècle. 
Depuis 2018, le Foyer bourgeoisial pour la jeunesse s’appelle SORA.

Hôpital des bourgeois
104 mètres linéaires de documents d’archives, vers 1300—XXe siècle
Ce fonds contient les documents de toutes les institutions charitables, dès le XIVe siècle, qui sont à l’origine de l’Hôpital des bourgeois, fondé en 1715. Il s’agit de l’Hôpital d’en-haut, de l’Hôpital d’en-bas et de l’Auberge des pauvres pèlerins, ainsi que de l’Hospice de Belp, qui était une succursale de l’Hôpital. Celui-ci disposait, pour son entretien, d’une vaste propriété foncière. Cela explique la richesse de ses archives en terriers, délimitations de parcelles, censiers, cartes, plans de dîmes et de domaines. Il ne s’est pas transmis de documents sur les pensionnaires. Les recueils de contrats, qui vont du XIVe au XIXe siècle, ne sont pas consultables, pour des raisons liées à leur état de conservation.

Burgerheim (aujourd'hui: Burgerspittel im Viererfeld)
4 mètres linéaires, XXe siècle
En 1952, la  Gesellschaft zu Zimmerleuten a suggéré de créer une maison de retraite pour la classe moyenne. Il s'agissait de bourgeois qui, en raison de leur âge ou de leur état de santé, n'étaient plus en mesure de tenir leur propre ménage, mais pour lesquels une admission au Burgerspital (subventionné) n'entrait pas en ligne de compte en raison de leur meilleure situation financière. Contrairement au Burgerspital, le Burgerheim, ouvert en 1967, devait être autosuffisant. Depuis le regroupement avec la Burgerspital en 2009, le Burgerheim s'appelle Burgerspittel im Viererfeld. Les dossiers du Burgerheim s'étendent de l'année 1957, une décennie avant la mise en service, jusqu'à l'année 1999. Les archives administratives se composent d'une part de dossiers et de procès-verbaux de la direction et des réunions internes à l’entreprise. D'autre part, les mandats de paiement et les pièces comptables des différents travaux de construction et d'entretien sont très volumineux, conformément à l'intense activité de construction (nouveau bâtiment, bâtiment ouest, rénovation de la façade et de la cuisine). Les comptes annuels et les rapports administratifs déjà livrés couvrent les années 1967–1993, la comptabilité financière court jusqu'en 1995.

Berner Generationenhaus
Le Berner Generationenhaus, ouvert en 2014 dans les locaux de l’ancien Hôpital des bourgeois, est trop récent pour que des documents relatifs à son aménagement et à son exploitation soient déjà archivés à la Bibliothèque de la Bourgeoisie.

Bibliothèque de la Bourgeoisie de Berne
44 mètres linéaires de documents d’archives, XVIe—XXIe siècles
Les archives administratives de la Bibliothèque de la Bourgeoisie comprennent deux parties. L’une contient des documents de l’ancienne Bibliothèque de la Ville et de la Haute école, jusqu’en 1951, notamment les procès-verbaux de la Commission de la Bibliothèque depuis 1579 et les comptes de la Bibliothèque depuis 1802. L’autre accueille les archives de la Bibliothèque depuis 1951, qui consistent uniquement en documents administratifs (à l’exclusion d’autres fonds d’archives ou de bibliothèques); il s’agit en particulier de la correspondance et des documents concernant les différentes séries de publication de la Bibliothèque de la Bourgeoisie de Berne.

Musée d’histoire naturelle
5.7 mètres linéaires de documents d’archives, 1801—1980
La Bibliothèque de la Bourgeoisie de Berne possédait depuis le XVIIe siècle un cabinet de curiosités, qui devint un musée autonome en 1832, installé dans des locaux distincts en 1882. Les archives administratives du Musée d’histoire naturelle se trouvent en partie à la Bibliothèque de la Bourgeoisie, en partie au Musée. Ce dernier abrite les archives scientifiques, tandis que le fonds conservé à la Bibliothèque se compose de dossiers et correspondances, d’archives personnelles de savants, ainsi que de dossiers et plans de construction.

DC Bank
Les archives de la Deposito-Cassa, fondée en 1825, ne se trouvent pas à la Bibliothèque de la Bourgeoisie de Berne. Cet institut administre la fortune de la Commune bourgeoise, s’occupe de transactions financières et se livre à des opérations bancaires pour ses clients, membres ou non de la Bourgeoisie. La DC Bank gère elle-même ses archives.